Популярность учения Парацельса послужила стимулом для изучения химического состава растений. Однако господствовавший до XVIII в. пирохимический метод анализа, при котором исследуемое вещество или растение сжигалось, конечно, не мог дать каких-либо существенных результатов. Французские химики XVII в. за 20 лет проанализировали таким путем 1400 растений и пришли к выводу, что зола их имеет примерно одинаковый состав, совершенно не связанный с особенностями воздействия того или иного растения на человеческий организм. И только с введением других методов анализа из растений были получены первые чистые органические вещества. Особенно плодотворными были исследования шведского фармацевта Карла Шееле (1742 - 1786 гг.), который выделил из растений больше чистых органических веществ, чем все предшествовавшие ему химики вместе взятые.
Карл Вильгельм Шееле родился в 1742 г. в Швеции, в городе Штральзунде. Пятнадцати лет он поступил учеником в аптеку в городе Готенбурге и прошел в ней обучение под руководством известных в стране химиков Лемери, Неймана и др. В это время аптеки в Европе являлись центрами химической науки, так как именно здесь химики находили практические приложения своих знаний, а также необходимые условия для проведения экспериментов. Многие выдающиеся химики начинали свою карьеру в аптеке, некоторые навсегда остались "аптекарями". "Аптекарем" был и основоположник современной химии Лавуазье, имевший аптеку, в которой и проводил научные исследования.
В 1768 г. Шееле переехал в Стокгольм. Здесь он познакомился с выдающимися шведскими химиками и сделал свое первое научное сообщение в Стокгольмской Академии.
В 1775 г. Шееле избрали в Академию и в том же году он стал управляющим, а затем владельцем аптеки в городе Чёпинге. Шееле до конца своих дней оставался в своей аптеке, целиком посвятив себя научным исследованиям, затрачивая на них большую часть своих доходов. В письме к одному из друзей он писал, что единственное желание его - открывать новые явления, получать новые химические соединения. Ранняя смерть на 44 году жизни прервала его плодотворные исследования, но и то, что им сделано, составило целую эпоху в химии растений или, как ныне называют этот раздел химии, - фитохимии.
Шееле разработал методы выделения из растений чистых органических кислот: он впервые выделил ряд кислот в кристаллическом виде и изучил их свойства. В 1769 г. Шееле выделил винную кислоту и позднее получил ее в кристаллическом виде. За сравнительно короткое время, с 1783 по 1786 г., Шееле открыл галловую, синильную, лимонную, щавелевую и яблочную кислоты и установил, что яблочная и лимонная кислоты содержатся во многих фруктах. Он впервые получил органические эфиры - соединения этилового спирта с органическими кислотами: уксусной и бензойной. В 1783 г. Шееле получил глицерин и доказал его присутствие в растительных маслах: оливковом, миндальном, льняном, масле какао и др. Им впервые был получен кислород.
Работы Шееле указали путь другим исследователям, которые стали постепенно отходить от водных или спиртовых извлечений и старались получать из растений индивидуальные вещества с определенными и постоянными физико-химическими свойствами.